在绘制 geom_bar() 时避免 ggplot 对 x 轴进行排序

r ggplot2

我有以下数据，我想用 ggplot 绘制：

SC_LTSL_BM    16.8275
SC_STSL_BM    17.3914
proB_FrBC_FL   122.1580
preB_FrD_FL    18.5051
B_Fo_Sp    14.4693
B_GC_Sp    15.4986

我想做的是制作条形图并保持条形的顺序（即从SC_LTSL_BM ...B_GC_Sp开始）。但是 ggplot geom_bar 的默认行为是对它们进行排序。我怎样才能避免这种情况？

  library(ggplot2)
  dat <- read.table("http://dpaste.com/1469904/plain/")
  pdf("~/Desktop/test.pdf")
  ggplot(dat,aes(x=V1,y=V2))+geom_bar()
  dev.off()

https://i.stack.imgur.com/BhGrf.png

Ben

你需要告诉 ggplot 你已经有了一个有序的因子，所以它不会自动为你排序。

dat <- read.table(text=
"SC_LTSL_BM    16.8275
SC_STSL_BM    17.3914
proB_FrBC_FL   122.1580
preB_FrD_FL    18.5051
B_Fo_Sp    14.4693
B_GC_Sp    15.4986", header = FALSE, stringsAsFactors = FALSE)

# make V1 an ordered factor
dat$V1 <- factor(dat$V1, levels = dat$V1)

# plot
library(ggplot2)
ggplot(dat,aes(x=V1,y=V2))+geom_bar(stat="identity")

https://i.stack.imgur.com/co7zB.png

而且，从技术上讲，它确实为您订购。默认值是按字母顺序排列的——这几乎不是您想要的，但很难想象一个更合理的默认值。

@Gregor我可能不知道它是按字母顺序排列的，直到你提到它。谢谢

AndrewGB

这是一种不修改原始数据，而是使用 scale_x_discrete 的方法。来自 ?scale_x_discrete，“使用限制来调整显示的级别（以及显示顺序）”。例如：

dat <- read.table(text=
                "SC_LTSL_BM    16.8275
              SC_STSL_BM    17.3914
              proB_FrBC_FL   122.1580
              preB_FrD_FL    18.5051
              B_Fo_Sp    14.4693
              B_GC_Sp    15.4986", header = FALSE, stringsAsFactors = FALSE)
# plot
library(ggplot2)
ggplot(dat,aes(x=V1,y=V2))+
  geom_bar(stat="identity")+
  scale_x_discrete(limits=dat$V1)

https://i.stack.imgur.com/eE2Vd.png

我认为这是更好的答案，因为它与堆叠条形图兼容，堆叠条形图将在列中重复相同的 ID，因此与转换为可排序因子不兼容。

Thomas Luechtefeld

dplyr 让您可以轻松地创建一个 row 列，您可以在 ggplot 中重新排序。

library(dplyr)
dat <- read.table("...") %>% mutate(row = row_number())
ggplot(df,aes(x=reorder(V1,row),y=V2))+geom_bar()

Romeo Kienzler

您也可以按照 here 所述重新排序相应的因子

x$name <- factor(x$name, levels = x$name[order(x$val)])

AndrewGB

如果您想避免更改原始数据，则可以使用 forcats 中的 fct_inorder（tidyverse 的一部分）来保持数据沿 x 轴的原始顺序（而不是将其更改为字母顺序） .

library(tidyverse)

ggplot(dat, aes(x = fct_inorder(V1), y = V2)) +
  geom_bar(stat = "identity")

输出

https://i.stack.imgur.com/wmKg9.png

forcats 的另一个选项是使用 fct_relevel 手动指定顺序。

ggplot(dat, aes(
  x = fct_relevel(
    V1,
    "SC_LTSL_BM",
    "SC_STSL_BM",
    "proB_FrBC_FL",
    "preB_FrD_FL",
    "B_Fo_Sp",
    "B_GC_Sp"
  ),
  y = V2
)) +
  geom_bar(stat = "identity") +
  xlab("Category")

数据

dat <- structure(list(
  V1 = c(
    "SC_LTSL_BM",
    "SC_STSL_BM",
    "proB_FrBC_FL",
    "preB_FrD_FL",
    "B_Fo_Sp",
    "B_GC_Sp"
  ),
  V2 = c(16.8275, 17.3914,
         122.158, 18.5051, 14.4693, 15.4986)
),
class = "data.frame",
row.names = c(NA, -6L))